浮运沉井一般采用一次制作浮运就位下沉或分段制作、底节浮运就位后在水上逐段接高下沉等方法。浮运沉井有三种下水方法：(1)在岸边拼装后，通过轨道溜放下水；(2)在导向船的承力架上边拼装、边下水；(3)用大型起重机起吊下水。
为便于沉井浮运就位，常采用以下三种方法增加浮力：(1)将沉井做成双壁空腔式，使之能自浮，浮运就位后在壁内灌水或灌筑混凝土使其下沉。(2)在钢沉井内加装气筒，浮运到位后，在沉井内部空间填充混凝土并接高沉井。为控制吃水深度，可在气筒内充入压缩空气，待沉入河底预定位置后，再除去气筒顶盖，挖泥(或吸泥)下沉。此法用钢量大，制造安装复杂，优质的沉井工程，宜用于深水大型沉井。例如，美国旧金山奥克兰湾桥和中国南京长江大桥均采用了这种方法。(3)在沉井底部加设临时底板，使其能在水中自浮，浮运就位注水沉入河底后，再拆除底板，挖泥下沉。中国南宁邕江大桥和美国塔科马海峡桥均采用了这种方法。
沉井下沉主要有干作业(排水)和湿作业(不排水)开挖下沉方法。(1)干作业法。是在沉井内无水情况下挖土下沉，常采用人工挖土或采用放入井底的机械挖土，服务满意沉井工程，将土装入斗内用吊车或提升架等从井中吊出运走，也可使用抓斗或长臂挖土机在井上操作挖土下沉。此法适用于在无地下水的土层中或降低地下水位后的土层中下沉沉井。(2)湿作业法。是在沉井内有水的情况下挖土下沉，挖土机械常使用抓斗、空气吸泥机和水力吸泥机等。此法适用于浮运沉井下沉和在地下水丰富的软弱土层中下沉沉井。(3)还有使用大直径钻机在井底钻挖或使用高压水将沉井先沉入土层后，再在井内挖土等方法。
沉井下沉到设计标高后，一般采用水下浇筑混凝土封底。根据受力或稳定要求决定井孔是否填充。填充有填砂石的，也有填混凝土的，但在低于冻结线0.25m以上部分必须用混凝土或圬工填实。
沉井外壁与土的摩擦力及刃脚踏面阻力是沉井下沉的主要阻力，天津沉井工程，常采用以下措施来克服或减少这些阻力：(1)增大井壁厚度或在沉井上部增加压重；(2)减小刃脚踏面宽度；(3)将沉井外壁做成斜坡形或台阶形；(4)采用卵石以减小摩擦力，即在沉井底节台阶上的井壁与土层之间，随着沉井边下沉边填入粒径为10～30mm的河卵石，由于卵石可随沉井向下滚动，故减小了与井壁的摩擦力；(5)射水法，即在沉井下部井壁外侧预埋射水管嘴，在下沉过程中射水以减少井壁周边阻力；(6)泥浆套法，即在沉井井壁和土层之间压注触变泥浆，形成泥浆套以减少摩擦力。触变泥浆是用粘性土、水和化学处理剂等按一定配合比搅拌而成。沉井下沉到设计标高后，为恢复沉井周边和土层之间的摩擦力，价格合理沉井工程，以增加沉井基础的承载力，需压入水泥浆以破坏及代替泥浆套。采用此法沉井下沉倾斜量小，容易纠偏，附近地面几乎无沉陷。该法不适用于不稳定土层、漏浆土层和河床易受冲刷的水中沉井；(7)空气幕法(壁后压气法)。即向预埋在井壁周围的气管中压入高压气流，气流由喷气孔喷出，沿沉井外壁上升，形成一圈压气层，使其周围土体松动或液化，从而减少井壁与土层之间的摩擦力；(8)通过沉井旁边的锚桩和反力梁，用千斤顶向下顶压沉井。这个方法可减轻沉井自重，便于穿过较薄的流砂层。
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